MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_2p

Total Repeats: 2458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015377	CGA	2	6	152	157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822094
2	NC_015377	GCGA	2	8	172	179	25 %	0 %	50 %	25 %	330822094
3	NC_015377	GACGAA	2	12	262	273	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330822094
4	NC_015377	GAT	2	6	315	320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822094
5	NC_015377	CCG	2	6	376	381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822094
6	NC_015377	GGT	2	6	405	410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822094
7	NC_015377	TGA	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822094
8	NC_015377	AACG	2	8	510	517	50 %	0 %	25 %	25 %	330822094
9	NC_015377	CAA	2	6	543	548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822094
10	NC_015377	ACT	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822094
11	NC_015377	CG	3	6	572	577	0 %	0 %	50 %	50 %	330822094
12	NC_015377	TCCTG	2	10	609	618	0 %	40 %	20 %	40 %	330822094
13	NC_015377	CAAG	2	8	648	655	50 %	0 %	25 %	25 %	330822094
14	NC_015377	GCT	2	6	679	684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822094
15	NC_015377	GC	3	6	698	703	0 %	0 %	50 %	50 %	330822094
16	NC_015377	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822094
17	NC_015377	CGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822094
18	NC_015377	A	7	7	724	730	100 %	0 %	0 %	0 %	330822094
19	NC_015377	CGA	2	6	735	740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822094
20	NC_015377	ATG	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822094
21	NC_015377	GC	3	6	792	797	0 %	0 %	50 %	50 %	330822095
22	NC_015377	CGATG	2	10	869	878	20 %	20 %	40 %	20 %	330822095
23	NC_015377	ACCGC	2	10	930	939	20 %	0 %	20 %	60 %	330822095
24	NC_015377	GCC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822095
25	NC_015377	TGCCCG	2	12	952	963	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330822095
26	NC_015377	GTG	2	6	989	994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822095
27	NC_015377	AAT	2	6	1002	1007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330822095
28	NC_015377	TCG	2	6	1186	1191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822095
29	NC_015377	GAT	2	6	1332	1337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822095
30	NC_015377	GTT	2	6	1341	1346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822095
31	NC_015377	GGC	2	6	1348	1353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822095
32	NC_015377	AGC	2	6	1399	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822095
33	NC_015377	TGT	2	6	1421	1426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822095
34	NC_015377	GA	3	6	1546	1551	50 %	0 %	50 %	0 %	330822095
35	NC_015377	ATC	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822095
36	NC_015377	GAA	2	6	1622	1627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822095
37	NC_015377	A	6	6	2889	2894	100 %	0 %	0 %	0 %	330822096
38	NC_015377	GCCG	2	8	2898	2905	0 %	0 %	50 %	50 %	330822096
39	NC_015377	CGG	2	6	2909	2914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822096
40	NC_015377	ATG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822096
41	NC_015377	CGA	2	6	2955	2960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822096
42	NC_015377	CG	3	6	3010	3015	0 %	0 %	50 %	50 %	330822096
43	NC_015377	TGA	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822096
44	NC_015377	CGA	2	6	3150	3155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822096
45	NC_015377	TGC	2	6	3168	3173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822096
46	NC_015377	ATGG	2	8	3268	3275	25 %	25 %	50 %	0 %	330822096
47	NC_015377	CGC	2	6	3365	3370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822096
48	NC_015377	TGC	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822096
49	NC_015377	TTCGT	2	10	3394	3403	0 %	60 %	20 %	20 %	330822096
50	NC_015377	GCTT	2	8	3449	3456	0 %	50 %	25 %	25 %	330822096
51	NC_015377	GCGTGA	2	12	3468	3479	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330822096
52	NC_015377	TGA	2	6	3504	3509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822096
53	NC_015377	CGTT	2	8	3668	3675	0 %	50 %	25 %	25 %	330822096
54	NC_015377	GCTCGA	2	12	3693	3704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330822096
55	NC_015377	CGC	2	6	3708	3713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822096
56	NC_015377	TGG	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822097
57	NC_015377	CG	3	6	4779	4784	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
58	NC_015377	ATC	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822097
59	NC_015377	CG	3	6	4853	4858	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
60	NC_015377	CGA	2	6	4872	4877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822097
61	NC_015377	AG	3	6	4886	4891	50 %	0 %	50 %	0 %	330822097
62	NC_015377	CGC	2	6	4901	4906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822097
63	NC_015377	GCC	2	6	4923	4928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822097
64	NC_015377	AGC	2	6	4950	4955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822097
65	NC_015377	GCGCCG	2	12	4962	4973	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
66	NC_015377	GGC	2	6	5102	5107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822097
67	NC_015377	CGG	2	6	5211	5216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822097
68	NC_015377	GA	3	6	5220	5225	50 %	0 %	50 %	0 %	330822097
69	NC_015377	GCC	2	6	5267	5272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822097
70	NC_015377	GC	4	8	5323	5330	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
71	NC_015377	CA	3	6	5339	5344	50 %	0 %	0 %	50 %	330822097
72	NC_015377	CGCTG	2	10	5359	5368	0 %	20 %	40 %	40 %	330822097
73	NC_015377	GCC	2	6	5371	5376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822097
74	NC_015377	GCG	2	6	5416	5421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822097
75	NC_015377	CGGC	2	8	5500	5507	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
76	NC_015377	CG	3	6	5530	5535	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
77	NC_015377	GC	3	6	5542	5547	0 %	0 %	50 %	50 %	330822097
78	NC_015377	TGC	2	6	5549	5554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822097
79	NC_015377	GCC	2	6	5556	5561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822097
80	NC_015377	CGGCAG	2	12	5612	5623	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330822097
81	NC_015377	CGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	50 %	50 %	330822098
82	NC_015377	GGC	3	9	6112	6120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822098
83	NC_015377	TTC	2	6	6138	6143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822098
84	NC_015377	GGC	2	6	6151	6156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822098
85	NC_015377	CGGC	2	8	6170	6177	0 %	0 %	50 %	50 %	330822098
86	NC_015377	GCGG	2	8	6198	6205	0 %	0 %	75 %	25 %	330822098
87	NC_015377	AAGG	2	8	6221	6228	50 %	0 %	50 %	0 %	330822098
88	NC_015377	AGG	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822098
89	NC_015377	CGG	2	6	6327	6332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822098
90	NC_015377	CAG	2	6	6369	6374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822098
91	NC_015377	CAG	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822098
92	NC_015377	GCC	2	6	6589	6594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822098
93	NC_015377	CTT	2	6	6633	6638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822098
94	NC_015377	TCG	2	6	6646	6651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822098
95	NC_015377	ATC	2	6	6652	6657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822098
96	NC_015377	TGA	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822098
97	NC_015377	GC	3	6	6702	6707	0 %	0 %	50 %	50 %	330822098
98	NC_015377	CG	3	6	6778	6783	0 %	0 %	50 %	50 %	330822098
99	NC_015377	GCG	2	6	6795	6800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822098
100	NC_015377	CAG	2	6	6849	6854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822098
101	NC_015377	TCT	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822098
102	NC_015377	AGC	2	6	6898	6903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822098
103	NC_015377	CAC	2	6	6915	6920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822098
104	NC_015377	GCA	2	6	6989	6994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822098
105	NC_015377	CTT	2	6	7011	7016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822098
106	NC_015377	TCC	2	6	7129	7134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822098
107	NC_015377	CAGGC	2	10	7170	7179	20 %	0 %	40 %	40 %	330822098
108	NC_015377	CG	3	6	7261	7266	0 %	0 %	50 %	50 %	330822098
109	NC_015377	TGGG	2	8	7280	7287	0 %	25 %	75 %	0 %	330822098
110	NC_015377	CGGC	2	8	7328	7335	0 %	0 %	50 %	50 %	330822098
111	NC_015377	CGT	2	6	7364	7369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822098
112	NC_015377	GTCC	2	8	7376	7383	0 %	25 %	25 %	50 %	330822098
113	NC_015377	TGG	2	6	7400	7405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822098
114	NC_015377	CGG	2	6	7675	7680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822099
115	NC_015377	AGC	2	6	7718	7723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822099
116	NC_015377	TCGA	2	8	7736	7743	25 %	25 %	25 %	25 %	330822099
117	NC_015377	GGAT	2	8	7746	7753	25 %	25 %	50 %	0 %	330822099
118	NC_015377	CAC	2	6	7790	7795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822099
119	NC_015377	TCGGCT	2	12	7832	7843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822099
120	NC_015377	CGG	2	6	7851	7856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822099
121	NC_015377	CGG	2	6	7911	7916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822099
122	NC_015377	CGC	2	6	7921	7926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822099
123	NC_015377	CG	3	6	7936	7941	0 %	0 %	50 %	50 %	330822099
124	NC_015377	TCG	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822099
125	NC_015377	CG	4	8	7962	7969	0 %	0 %	50 %	50 %	330822099
126	NC_015377	CT	3	6	7970	7975	0 %	50 %	0 %	50 %	330822099
127	NC_015377	CTT	2	6	8010	8015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822099
128	NC_015377	CGG	2	6	8102	8107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822099
129	NC_015377	CCA	2	6	8118	8123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822099
130	NC_015377	AGCG	2	8	8157	8164	25 %	0 %	50 %	25 %	330822099
131	NC_015377	GC	3	6	8182	8187	0 %	0 %	50 %	50 %	330822099
132	NC_015377	GGT	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822099
133	NC_015377	GC	3	6	8246	8251	0 %	0 %	50 %	50 %	330822099
134	NC_015377	GGC	2	6	8274	8279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822099
135	NC_015377	GCG	2	6	8375	8380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822100
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137	NC_015377	GTCG	2	8	8395	8402	0 %	25 %	50 %	25 %	330822100
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243	NC_015377	CGCCA	2	10	12325	12334	20 %	0 %	20 %	60 %	330822100
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248	NC_015377	CCA	2	6	12507	12512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822100
249	NC_015377	CGA	2	6	12526	12531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822100
250	NC_015377	TGG	2	6	12549	12554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822100
251	NC_015377	CGA	2	6	12616	12621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822100
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253	NC_015377	TCG	2	6	12735	12740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822100
254	NC_015377	AGCC	2	8	12750	12757	25 %	0 %	25 %	50 %	330822100
255	NC_015377	G	6	6	12777	12782	0 %	0 %	100 %	0 %	330822100
256	NC_015377	GAC	2	6	12802	12807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822100
257	NC_015377	GTG	2	6	12818	12823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822100
258	NC_015377	TGC	2	6	12858	12863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822100
259	NC_015377	CGA	2	6	12973	12978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822100
260	NC_015377	TTGGC	2	10	13094	13103	0 %	40 %	40 %	20 %	330822100
261	NC_015377	CGT	2	6	13132	13137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822100
262	NC_015377	CGG	2	6	13167	13172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822100
263	NC_015377	GC	3	6	13248	13253	0 %	0 %	50 %	50 %	330822100
264	NC_015377	ATC	2	6	13279	13284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822100
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393	NC_015377	GCC	2	6	19743	19748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822109
394	NC_015377	ATG	2	6	19764	19769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822109
395	NC_015377	CT	3	6	19813	19818	0 %	50 %	0 %	50 %	330822109
396	NC_015377	TGC	2	6	19852	19857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822109
397	NC_015377	GAC	2	6	19929	19934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822109
398	NC_015377	ACC	2	6	20062	20067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822110
399	NC_015377	GC	3	6	20136	20141	0 %	0 %	50 %	50 %	330822110
400	NC_015377	CTG	2	6	20249	20254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822110
401	NC_015377	CGT	2	6	20284	20289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822110
402	NC_015377	CGGT	2	8	20306	20313	0 %	25 %	50 %	25 %	330822110
403	NC_015377	TGCGC	2	10	20500	20509	0 %	20 %	40 %	40 %	330822110
404	NC_015377	CGA	2	6	20517	20522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822110
405	NC_015377	GCGA	2	8	20533	20540	25 %	0 %	50 %	25 %	330822110
406	NC_015377	CTG	2	6	20546	20551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822110
407	NC_015377	GTC	2	6	20582	20587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822110
408	NC_015377	TGC	2	6	20704	20709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822110
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410	NC_015377	AG	3	6	20737	20742	50 %	0 %	50 %	0 %	330822110
411	NC_015377	CGG	2	6	20752	20757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822110
412	NC_015377	TTG	2	6	20870	20875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822110
413	NC_015377	TGCTG	2	10	20963	20972	0 %	40 %	40 %	20 %	330822110
414	NC_015377	GCG	2	6	21009	21014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822110
415	NC_015377	TCA	2	6	21240	21245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822110
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417	NC_015377	TCG	2	6	21309	21314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822110
418	NC_015377	TAC	2	6	21366	21371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822110
419	NC_015377	CTG	2	6	21381	21386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822110
420	NC_015377	CGA	2	6	21400	21405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822110
421	NC_015377	GCG	2	6	21439	21444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822110
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423	NC_015377	C	6	6	21590	21595	0 %	0 %	0 %	100 %	330822110
424	NC_015377	GCG	2	6	21720	21725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822110
425	NC_015377	GC	3	6	21748	21753	0 %	0 %	50 %	50 %	330822110
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427	NC_015377	CTG	2	6	21961	21966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822110
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429	NC_015377	CCG	2	6	21979	21984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822110
430	NC_015377	GTG	2	6	22046	22051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822110
431	NC_015377	TCCCG	2	10	22100	22109	0 %	20 %	20 %	60 %	330822110
432	NC_015377	CGA	2	6	22132	22137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822110
433	NC_015377	CGAG	2	8	22161	22168	25 %	0 %	50 %	25 %	330822110
434	NC_015377	TTG	2	6	22180	22185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822110
435	NC_015377	GC	3	6	22225	22230	0 %	0 %	50 %	50 %	330822110
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470	NC_015377	CAG	2	6	23704	23709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822110
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473	NC_015377	GTA	2	6	23773	23778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822110
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476	NC_015377	GCACG	2	10	23891	23900	20 %	0 %	40 %	40 %	330822111
477	NC_015377	TCGA	2	8	23902	23909	25 %	25 %	25 %	25 %	330822111
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498	NC_015377	CGG	2	6	24806	24811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822111
499	NC_015377	CG	4	8	24845	24852	0 %	0 %	50 %	50 %	330822111
500	NC_015377	CGA	2	6	24959	24964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822111

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